主要故事情节：
一向平静的大海里突然出现了一系列骇人听闻的怪事，一只巨大的怪物出没其间，兴风作浪。
于是美国的战舰林肯号配备了强大的武器去寻找并消灭这个庞然大物。经过长时间的搜索，林肯号和怪物遭遇了。在一场战斗之后，林肯号收到了重创，而随船长探险的博物学家大龙那斯教授和鱼叉手之王尼德兰、仆人康塞尔神奇地进入了怪物的内部
原来这是一艘巨大的潜水艇——诺第留斯号。船长尼摩为了不让自己的秘密泄露出去，便把他们软禁在潜水艇中，从此，他们与诺第留斯号在一起，开始了海底两万里的探险。其间，他们看到了海底神奇的世界，他们惊奇不已，叹为观止。同事，他们也进行了许多新的探索，有很多新的发现。