第一份档案（第260号）：“兵部为开列依遵拨给皇极殿做工班军赏银事行稿”（尾缺），天启六年十一月二十七日。
这份档案记载的是兵部应职方清吏司主事官员的奏请，给参与皇极殿做工的山东都司、河南都司第壹、贰、叁、肆拨的做工班军发“赏银”一事。奏疏称，按规定，参加修工的军人，每人每班该发赏银八分，其中五分由户部负责发放，三分由兵部负责。奏疏详细开列了山东、河南二都司班军凡三拨参与皇极殿修工的起止时间，做工日期，领工官员姓名，做工人数，以及兵部应负责的银两数等。
皇极殿（原奉天殿，嘉靖时重修后改名）正式重修的时间在天启帝即位之始。泰昌元年（万历四十八年，1620）八月，熹宗即位之初，即下诏：“传起建皇极门殿，择日兴工，以文华殿窄小，百官朝贺列班不便也。时辽饷愈急，大工起建，有司莫措。乃以工部请发内帑二百万，刻日起工。”“百官朝贺列班不便”的实际情况确实如此，皇极等殿不修，严重影响到国家典礼和宫廷仪制的举行。万历末年，南京兵部尚书黄克缵在疏请神宗“修省”时也曾说，“圣明御宇以来，火灾示惊者屡矣。一见于乾清宫，而宸居非旧；再见于皇极殿，而视朝无所也”。“视朝无所”，真是一个现实问题。自天启三年始，随着皇极门的修复和皇极殿修建的进行（尚未最终完工），一些重要的朝贺、南郊、婚礼、岁贺、颁历等礼仪已在皇极门或皇极殿内象征性地举行了。

皇极殿完工的时间早于其他二殿。赵翼称“天启六年九月，皇极殿成。七年八月，中极、建极殿成”，是指主体建筑完成时间。《明熹宗实录》载：天启六年四月，“内官监恭进‘皇极殿’牌额。得旨。所进三字，端严堪用。着即颁刻，择吉悬安”。六月时，熹宗说“皇极殿工已八九”。至当年九月，“上御皇极门内殿，礼部进天启七年祀册”，次年十月初一日，熹宗又“御皇极殿颁历”，说明皇极殿投入使用。此外，信王朱由校（即后来的崇祯皇帝）的婚礼，时间在天启六年底至七年初，仪式也安排在皇极殿内举行。这里既表明皇极殿的完成，其功能业已恢复，同时也反衬了皇极殿的政治地位此前的确受到很大的影响。
第一份兵部“行稿”所列河南、山东二都司班军参与皇极殿做工的时间始自天启六年七月初一日，每拨15天，每拨人数在700人至1100人不等。每拨有3批军人同时做工，连续至少有4拨人马（结合第二份档案，同时用工达八九拨），同时有数千名班军在皇极等做工，工程量很大。从工程进度看，这拨班军负责的应该是这次大修的扫尾工作。

第二份档案（第286号）“兵部为开列依遵拨给建极殿做工班军赏银事行稿”，天启七年七月十六日。
其内容是兵部职方清吏司疏奏，按规定给参与建极殿做工的中都等三都司，即中都留守司、山东都司、河南都司的班军，包括第柒、捌、玖等三拨发赏银。按第一份奏议相同的规定，参加修工的都司班军，每人每班该发赏银八分，其中五分由户部负责发放，三分由兵部负责。参与做工的中都、山东、河南三都司的班军，每拨同样是15天（或以实际15天计），每拨各有领工官的名字，以及兵部应当负责的银两数等。不同的是，这份完整的奏疏所列人数比修皇极殿的人数更多，做工的时间在天启七年四月十八日至六月初八日。
建极殿（原谨身殿，嘉靖重修后更名）和中极殿（原华盖殿，嘉靖时改名）是同时修建的，竣工时间在天启七年八月，这也标志着“三殿”重修工程的最终完成。
熹宗本人喜爱土木建筑、工程制造，对中极、建极二殿的修建，也颇为关注，《明熹宗实录》颇为简洁地记载了两大殿重修的主要环节，以及熹宗亲自过问的主要仪式。
天启六年十一月庚辰，建极殿竖立金柱，遣尚书薛凤翔行礼，赐辅臣黄立极等银币有差。天启七年二月己亥，迎建极殿金梁，赐辅臣黄立极等茶。辛丑，建极殿升梁，赐辅臣黄立极等茶。乙巳，以建极殿升梁，赐辅臣黄立极等银各五十两。三月丙申，以建极殿安吻，赐辅臣黄立极等银各五十两。

中极殿的金梁安装稍稍晚于建极殿约两月，据载：
迎中极殿金梁。上命升梁祭告，遣工部尚书薛凤翔迎梁，神木厂尚书杨梦衮，广渠门尚书孙杰，正阳门尚书崔呈秀，大明门尚书王之臣，午门尚书郭允厚，皇极门尚书周应秋，各行礼。……己卯，中极殿升梁。赐大学士黄立极、施凤来、张瑞图、李国【木普】各银五十两，中书官张承爵等各五两。
中极殿升梁，也是三大殿工程浩大而隆重的仪式，崔呈秀等“阉党”成员纷纷登场迎接，其政治深意尚待分析。
时至天启七年八月乙未，随着中极殿、建极殿插剑悬牌仪式的举行，三大殿重建工作基本告成。十天之后（甲寅日），司礼监王体乾传熹宗之意，宣布“殿工告成”，大学士黄立极、施凤来、张瑞图、李国即奉命题请皇上宣谕天下。次日，“上崩于乾清宫”。三殿完工，熹宗即去世。可以说，熹宗一朝，也是三大殿重建的一朝，三殿的修建伴随他在位七年之始终。
第二份档案记载的三都司做工时间，起自四月十八日，截至六月初八日，此时金梁已升，距离完工尚有月余，但也进入了大殿修建的最后收尾阶段。之所以没有延续到三大殿建成之后的扫尾，大约是熹宗病重（并很快去世），宣布殿工告成，更有政治意义。

第三份，三都司班军参与大殿修建的兵部档案（第294号），题名“兵部为举劾皇工本卫指挥姚应爵等侵克军粮事行稿”，天启七年八月初五日，是中都司所领参与三殿修筑官军举报军粮被侵占一事的行稿。据滁州卫班军林春芳称，他们于天启七年正月十六日“接替皇工”，应当分得的军饷被卫指挥“侵冒”，数量达300两之多。
虽然这份档案并没有明确指出滁州卫班军参与的“皇工”就是三殿的修建，但从班军到京参与的做工规定、参加做工的时间，以及军饷之数量看，林春芳等班军参加的必是三殿大修。
第一份档案已残缺，其记载的班军做工编为一、二、三、四等四拨，时间在天启六年的七、八月间；第二份档案完整，记载的班军做工编号为七、八、九等三拨，时间在天启七年的四、五、六三月。这里恰恰缺少了天启六年下半年至七年之初的这一段时间，这大约是第五、六等拨上班做工的时间。